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转录蛋白九转象限图
转录组与蛋白组基于log2FC值的关联分析,展示基因与蛋白的表达量变化关系
基因ID转换
提供模式物种的Ensembl GeneID、Entrez GeneID、Symbol相互转换功能
KEGG查询KO编号对应基因
批量获取KO编号对应的基因名称
KEGG查询CO编号对应物质
批量获取CO编号对应的物质名称
KEGG通路ID与CO编号互联
批量获取KEGG通路ID所涉及的CO编号,或批量获取CO编号所参与的KEGG通路ID
KEGG通路ID与KO编号互联
批量获取KEGG通路ID所涉及的KO编号,或批量获取KO编号所参与的KEGG通路ID
KEGG通路名和编号互转
批量获取通路名称对应的通路编号,或批量获取通路编号对应的通路名称
亚细胞定位注释
对上传的蛋白或核酸的fasta序列进行亚细胞定位注释
转录因子注释
对上传的蛋白或核酸的fasta序列进行转录因子注释
表格合并
根据两表的共有列合并表格
动态韦恩图
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Classyfire鉴定
对上传的化合物进行鉴定,获取化合物对应的分类信息并绘制饼图展示
批量查询PubChem
上传一个包含要查询对象列的xlsx表,返回PubChem数据库中对应的化合物信息
SSR分析及引物设计
对序列进行SSR位点分析及引物设计
KEGG富集分析
获取上传基因集合的富集到的代谢通路信息。
生存分析图
用于描述研究群体的生存时间,能够直观地评估不同因素或治疗对生存率的影响
DESeq2
DESeq2用于进行差异表达分析,通过模型化基因表达数据的负二项分布,评估基因的表达变化。
代谢组学格式转换
将代谢组学中常见的原始数据格式进行格式转换
环形热图
环状热图也是热图的一种,适合多组或多组学的研究。
KOG注释
对上传的蛋白或核酸的fasta序列进行KOG注释并绘图
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对上传的蛋白或核酸的fasta序列进行PFAM数据库注释,获取结构域信息
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对上传的蛋白或核酸的fasta序列进行KEGG数注释,获得KO功能注释信息
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对上传的蛋白或核酸的fasta序列进行GO数据库注释,获得功能注释信息
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时间序列分析
时间序列分析用于分析基因表达数据,研究基因如何在不同时间点响应环境变化或生物过程。
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XCMS
XCMS是一个用于质谱数据处理工具,能够进行峰检测、峰对齐和定量分析
MSP文件信息提取
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GO富集分析
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平行坐标图
是一种不同类别高维数据的可视化方法,常用于一些分类问题及回归问题中。
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通过颜色差异来表示数值大小,常用于展示变量之间的相关性。
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通过交叉的圆来表示集合及其交集,直观地展示元素之间的关系和相互作用。
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通过点的分布来表示数据的分布和离散程度,常用于展示数据集的统计特性。
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通过颜色和长度的变化来表示数据的大小和分布,常用于展示多个变量的相关性和比较。
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MA图通过M(比值)和A(强度)两个参数来展示基因表达的变化。
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